Setelah operasi besar-besaran yang berujung pada penahanan rekrutan baru Kafka Hibino, yang juga dikenal sebagai Kaijuu No. 8, Pasukan Pertahanan merasa bingung harus bagaimana menangani dirinya. Kafka adalah kaijuu pertama yang berpihak pada manusia, dan setelah pertimbangan matang, ia akhirnya dipindahkan ke Divisi Pertama Pasukan Pertahanan dengan harapan dapat menambah kekuatannya ke dalam divisi terkuat yang mampu menangani ancaman apa pun. Namun, masih ada yang meragukan Kafka, dan ia harus membuktikan kemampuannya dalam misi berikutnya.

Kafka dan Divisi Pertama segera dikerahkan ketika gerombolan besar kaijuu yang menyerupai semut mulai menimbulkan kekacauan. Berkat kekuatan gabungan teman Kafka, Kikoru Shinomiya, dan kapten mereka, Gen Narumi, misi tersebut tampaknya berjalan sesuai rencana. Namun, ketika Kafka gagal bertransformasi menjadi wujud kaijuu-nya, Kaijuu No. 9 yang menakutkan ikut bergabung dalam pertempuran dengan satu tujuan saja—menghabisi Kafka dan mencuri kekuatannya. Meskipun situasinya tampak suram, Kafka harus mengatasi ujian terberatnya sejauh ini bersama yang lain jika ia ingin terus mengejar mimpinya: bertarung berdampingan dengan teman masa kecilnya sekaligus kapten Divisi Ketiga, Mina Ashiro.

[Ditulis oleh MAL Rewrite]

Catatan: Sinopsis diterjemahkan secara otomatis oleh Google Translate.